Администрация ОАО «Аэропорт Толмачево» приоритетными задачами своей деятельности ставит обеспечение авиационной безопасности и антитеррористической защищенности предприятия. Обеспечение авиационной безопасности в аэропорту Новосибирск (Толмачёво) осуществляется службой авиационной безопасности (САБ) в соответствии с требованиями нормативных документов.