Транспортные авиаэскадрильи видов и родов Вооруженных Сил переданы в состав Военно-воздушных сил РФ. В частности, в состав ВВС отданы авиаподразделения Сухопутных войск, ВДВ, Космических войск, войск радиационной, химической и биологической защиты. Собственная транспортная авиация сохранится лишь в РВСН