С августа 2013 года по сентябрь 2015 года ОАО «Аэропорт Внуково» пользовалось федеральным имуществом безвозмездно. В ходе проверки, проведенной Счетной палатой, были отмечены факты отсутствия надлежащим образом оформленных отношений по использованию объектов федеральной собственности ФГУП «Администрация гражданский аэропортов» (ФГУП «АГА(А)») с оператором аэропорта ОАО «Аэропорт «Внуково».