ООО «Авиакомпанией «Томск Авиа» в 2013 году перевезено на регулярных рейсах 85,3 тыс. пассажиров, что на 32,5 %, или 20,9 тыс. человек больше, чем в 2012 году. Количество перевезенных пассажиров увеличилось за счет выполнения новых пассажирских рейсов из Новосибирска в Стрежевой, в Кызыл, Абакан, Горно-Алтайск, Томск, Кемерово, Новокузнецк, Барнаул.